広告を出している広告主企業が、
特定のアフィリエイトサイトにのみ広告を出している場合には、
自分のサイトに掲載したい広告を掲載できる可能性が広がりますし、
複数のアフィリエイトサイトに広告を出している場合、
1つのアフィリエイトサイトで広告プロモーションを終了しても、
他のアフィリエイトサイトで広告をサイトに掲載することも可能です。

また、同じ広告でも、複数のアフィリエイトサイトの報酬を
比較して、一番報酬の高いアフィリエイトサイトから広告を貼る、
といったこともできると思います。

ですので、複数サイトと提携するようにしましょう。